A Fundação Uniselva está registrada e credenciada pelo Ministério da Educação (MEC) e pelo Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (MCTIC) como a Fundação de Apoio à Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT). Ela também tem autorização para oferecer apoio ao Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso (IFMT), à Universidade Federal de Rondonópolis (UFR), ao Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso do Sul (IFMS), à Universidade Federal de São João del-Rei (UFSJ) e ao Instituto de Pesquisa do Pantanal (INPP). Além disso, a Uniselva é habilitada pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) para realizar importações de bens destinados à pesquisa científica e tecnológica, com isenção de impostos.